Le conseil d’unité ou de laboratoire a un rôle consultatif et émet un avis sur toutes les questions liées à l’organisation, au fonctionnement et à la vie de l’Unité.
Il est composé de représentants de toutes les catégories de personnels, 12 élus, 6 nommés par le directeur et 2 membres de droit (directeur et directeur adjoint).
Il se réunit 3 ou 4 fois par an sur convocation du directeur ou à la demande d’au moins un tiers de ses membres.